Actualités RFMF

 Mots clés: Metabolomique, MS/MS, Workflow4Metabolomics, Galaxy, R, Intégration d’outil

Contexte
L’émergence du domaine de la métabolomique s’est accompagnée de la génération de vastes ensembles de données caractérisés par différents niveaux de complexité (multidimensionnalité, redondance, bruit,…). Un certain nombre d’outils, procédures, bases de données, et cadres normalisés existent aujourd’hui, mais l’utilisateur doit encore naviguer entre différents logiciels pour les utiliser avec les contraintes d’installation des outils et de reformattage des entréee et sortie des outils. L'environnement Galaxy permet de fédérer ces outils au sein d’une même instance. Dans le cadre du développement de nouveaux outils et du déploiement de nouvelles solutions nous recherchons un(e) ingénieur motivé pour contribuer au projet Workflow4Metabolomics et renforcer les équipes impliquées.
 

CDD 18 mois, Intitulé du poste : Ingénieur d’Etudes en Analyse de Biomolécules Végétales
Date limite de candidature : 15 juillet 2017

A 3-year PhD scholarship for a project on chlorinated paraffins is available at LABERCA (Oniris, France).

Titre: Exploration de la dynamique des modulations du réseau métabolique hépatique lors de l'exposition à un contaminant perfluoré émergent

Mots clés : toxicologie, effets métaboliques, contaminant alimentaire, réseaux métaboliques, bio-informatique, modèles cellulaires, métabolisme hépatique, métabolomique
 
Encadrants & personnes à contacter pour la candidature :
Dr. Daniel Zalko, toxicologue (daniel.zalko@inra.fr)
Dr. Nathalie Poupin, bio-informaticienne (nathalie.poupin@inra.fr)
 

Title
Innovative data mining strategies for natural extracts metabolomics, natural products dereplication and bioactives identification.

OBJET DU POSTE
L'un des principaux objectifs du Groupe Biomarqueurs (BMA) est le recueil de données métabolomiques complexes par spectrométrie de masse dans le cadre d'études épidémiologiques et d’intervention sur l'étiologie du cancer.

Une école chercheur métabolomique « Comprendre et initier des analyses en métabolomique » cofinancé par corebiopaca et le rfmf a été organisée à Marseille (Station d’Endoume) le 12 et 13 déc 2016.

Niveau recherché/mission générale : Ingénieur(e) de Recherche, chargé(e) d’animer un réseau de plates-formes et des projets analytiques en « analyse structurale et métabolomique »
 
Mots clés : Animation, Gestion Projet, Métabolomique
 

Sujet : Développement d’approches de profilage non ciblé pour la mise en évidence de dangers chimiques émergents : application à l’identification de nouveaux marqueurs d’exposition interne chez l’Homme au service de la biosurveillance et de l’étude du lien entre exposition chimique et santé humaine

 

Title: Overcoming the challenge of biomarkers structural elucidation

For further information please contact the project coordinator, Dr Gaud Dervilly-Pinel (gaud.dervilly@oniris-nantes.fr)
Application Please submit your application no later than 17th March 2017.

prix de Thèse 2017

10/02/2017
Le RFMF et le RFMF junior ont le plaisir d’annoncer la première édition du prix de thèse RFMF. Ce prix, destiné aux nouveaux chercheurs francophones, a pour but de récompenser et valoriser les travaux de recherche dans les domaines de la métabolomique et de la fluxomique. Le lauréat sera invité aux frais du RFMF au congrès SMMAP 2017 pour recevoir un chèque de 500 € et présenter ses travaux.

Le RFMF Junior lance sa première école printanière !

Rendez-vous du mardi 2 au vendredi 5 mai 2017.

Le RFMF Junior lance sa première école printanière !

Rendez-vous du mardi 2 au vendredi 5 mai 2017.

Cette année encore, les JS ont été un moment riche: rencontres, science, partage. Grâce au comité local d'organisation, au CA du RFMF, au comité scientifique et aux animateurs des ateliers, mais surtout grâce à tous les participants, ces journées ont tenu toutes leurs promesses.

   Elles ont aussi été l'occasion pour les juniors de se réunir autour de deux évènements importants: la première table ronde et l'élection du nouveau CA.

   Nous tenons bien évidemment à remercier tous les jeunes présents lors de la table ronde et qui, par leur motivation et leur participation, ont contribué à son bon déroulement et la richesse des échanges. Beaucoup d'idées et d'avis ont été donnés à propos de recherche d'emplois et de réseaux. Nous préparons pour tous un retour sur l'essentiel échangé lors de cette rencontre.

   Pour la première fois depuis sa création, le RFMF Junior a aussi organisé l'élection de son nouveau CA. Une fois de plus, nous vous remercions pour votre participation à ce moment important dans la vie de notre réseau. 9 membres du CA ont ainsi été élus à la fin de notre assemblée générale:

Sandrine Aros-Calt
Djawed Bennouna
Antoine Buonomo
Sylvain Dechaumet
Grégory Genta-Jouve
Maximilien Gonçalves-Martins
Corentine Goossens
Justine Leenders
Guillaume Meiffren

Attention candidatures avant le 30/11/2016!

Attention délais de réponse court (21/11/2016)

Thèse Cifre Amélioration de la production d’arômes atypiques par les levures oenologiques au cours du procédé de fermentation. Montpellier

URGENT CDD 12 mois – Assistant ingénieur en techniques d’analyse de biomolécules (emploi type CNRS B3A21)
 

Félicitations à Christophe Junot pour son élection à la Metabolomics Society:

Election of Directors

We are pleased to announce that the following have been elected to the Board of Directors of the Metabolomics Society for 2016:
Dr Christophe Junot, CEA, Paris, France (newly elected)

Proposition de stage Master 2 (6 mois), année universitaire 2016-2017 :
Développement d’une méthode de quantification des polyphénols du chocolat par UHPLC-MRM-MS

PhD Position open in Pr S. Rudaz group


Prochaines journées scientifiques: en 2017, le RFMF organise ses 11èmes journées scientifiques en partenariat avec la Société Française d’Electrophorèse et Analyse Protéomique et la Société Française de Spectrométrie de Masse. Le congrès commun, baptisé SMMAP2017, aura lieu du 2 au 5 octobre 2017 à Marne-la-Vallée. Il permettra de découvrir, en plus des technologies et applications de référence du RFMF, de nouveaux espaces d'échanges interdisciplinaires et de nouvelles communautés scientifiques. Rendez-vous sans plus attendre sur le site : https://smmap2017.sciencesconf.org/

Offre Thèse Swansea UK

Metabolic profiling to evidence exposure and effects markers of pharmaceuticals in the Mediterranean mussel - deadline 30 sept 2016


Approche métabolomique pour la mise en évidence de marqueurs d’exposition et d’effet à des rejets dilués de STEU chez la moule méditerranéenne

Les 10èmes Journées encore un succès!
Les 10 èmes journées scientifiques du RFMF ont eu lieu à Montpellier du 31 mai au 2ème Juin 2016. 260 participants de  France et de l'étranger étaient présents aux 3 jousr de conférences  et 6 aux ateliers thématiques tenus la veille. L'événement a été un grand succès grâce à l'engagement des comités scientifiques et de l'organisation, et à l'implication grandissante des jeunes chercheurs francophones dans le domaine (RFMF junior). 4 conférenciers invités internationaux ont donné un aperçu vaste et passionnant de l'activité de recherche dans le domaine. Les 26 conférences et 83 posters ont été l'occasion de voir l'activité croissante de la recherche dans le domaine de la métabolomique et fluxomique dans la communauté de langue française.
La politique du RFMF de maintenir des prix de congrès aussi bas que possible a permis une forte présence de jeunes scientifiques (34% de moins de 33 ans). Last but not least, le mantra RFMF a été soigneusement suivi: "Bonne bouffe, Bonne Science!"


Les vidéos des conférences plénières proposées lors des 10èmes Journées Scientifiques du RFMF sont désormais disponibles.

Pr. Elizabeth Hill
Metabolomics for characterising the chemical exposome and its effects

Pr. Arthur Edison
Strategies to integrate NMR and mass spectrometry in metabolomics

Dr. Patrick Kiefer
DynaMet, a fully automated pipeline for dynamic LC-MS data

   Vous retrouverez dans la rubrique Blog nos précédentes actualités ainsi que nos lettres d'informations!

   Le RFMF Junior sera présent aux 10eme Journées Scientifiques du réseau à Montpellier. Ces journées seront l'opportunité de renouveler le Conseil d'Administration Junior. Tous les jeunes impliqués dans les domaines de la métabolomique et de la fluxomique sont donc invités à participer avec nous à la vie de ce réseau.


  Poste de Manager R&D  au sein de notre société APTEEUS en CDI

Information du 13 avril 2016 : Inscriptions closes

Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique
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