Actualités RFMF

MOOC usemetabo 2018

20/07/2018
Le RFMF participe à l'organisation d'un MOOC sur la Métabolomique.

 
Les dates à retenir Ouverture des inscriptions : 27 juin 2018

Début du cours : 1er octobre 2018

Fin du cours : 7 novembre 2018

 Le MOOC sur la Métabolomique est ouvert aux inscriptions sur le site de FUN
Ce MOOC usemetabo sera ouvert du 1er octobre  au 7 novembre 2018. 

Recherche Ingénieur d’Etudes, sous contrat à durée déterminée,
pour la plateforme de profilage métabolique et de métabolomique (P2M2)
sur le site de l’INRA de Rennes- Le Rheu (Centre de Bretagne-Normandie).

Retrouvez les présentations et les notes de la discussion dans nos actualités passées :

http://www.rfmf.fr/actualites/journees-scientifiques-ateliers-passes/

Déterminants moléculaires de la résistance au puceron vert (Myzus persicae) chez le pêcher (Prunus persica) : étude multi-omique des réponses à l'infestation et analyse du mode d'action de l'acide 3,5 dicaféolyquinique.

Mots clefs : biopesticide, résistance aux pucerons, phloème, métabolomique in situ, transcriptomique, métabolismes primaires et secondaires, LC-MS, GC-MS.

Merci à tous pour cette journée fructueuse de rapprochement des communautés protéomique et métabolomique, organisé par les sociétés savantes et infrastructures nationales, qui s'est tenue le 28 mars 2018 à Lyon dans le cadre de Forum Labo (https://www.forumlabo.com/ForumlaboLyon/conference.php).

A très bientôt pour de prochaines rencontres !

Présentations

  • Introduction : présentations des sociétés et infrastructures en protéomique et métabolomique [Christine Carapito, Anne-Emmanuelle Hay de Bettignies, Myriam Ferro, Etienne Thévenot, Télécharger le fichier]
  • Stratégies d'acquisition/interprétation des données en protéomique [Christophe Bruley, CEA-Grenoble, Télécharger le fichier]
  • Traitement et analyse des données en métabolomique [Etienne Thévenot, CEA-Saclay, Télécharger le fichier]
  • Banques et dépôts de données en protéomique [Christine Carapito, CNRS-Strasbourg, Télécharger le fichier]
  • Banques de données, bases de connaissance et dépôts de référence en métabolomique [Franck Giacomoni, INRA, Clermont Ferrand, Télécharger le fichier]
  • Traitement et analyse des données en protéomique [Mélisande Blein-Nicolas, INRA-Moulon, Télécharger le fichier]
  • Analyse des données omiques dans le contexte des réseaux métaboliques [Nathalie Poupin, INRA-Toulouse, Télécharger le fichier]
  • Omics integration and modeling: Prediction of proteins lifetime of tomato fruit [Isma Belouah, INRA-Bordeaux, Télécharger le fichier]
Discussion commune

Le profil du poste recherché
Recrutement d'un ingénieur métabolomique en spectrométrie de masse haute résolution
Poste en CDD de d’un an, à pourvoir dès que possible.
Localisation: Unité NORT INRA1260/INSERM1062/AMU, faculté de Médecine la Timone,
27 boulevard Jean Moulin, 13385 Marseille
contact: JC Martin, tél 04 91 32 46 63/07 77 23 00 34, jean-charles.martin@univ-amu.fr

A 18 months’ post doc position is available at LABERCA (Oniris, Nantes, France) in close cooperation with McGill University (Québec, Canada).
The project will be starting in September 2018.
Proposal title: “Contribution to chemical risk evaluation through assessment of global contamination of fish samples, from historical to emerging contaminants”

Prix Poster 2018

12/02/2018

Lors des 11èmes Journées Scientifiques du RFMF, trois prix de poster seront décernés :

  • un prix du meilleur poster "RFMF 2018" toutes catégories,
  • un prix du meilleur poster "spécial jeunes chercheurs" (Masters, Doctorants, Post-Doctorants),
  • un prix de la meilleure communication flash 180 sec

A 12 months’ position for a Postdoctoral Researcher Fellowship in metabolomics is available at LABERCA (Oniris, France) in close collaboration with French Anti-Doping Agency (AFLD, Chatenay Malabry, France). The project, funded by the US-Anti Doping Agency (USADA) will be starting in spring 2018.

Une journée commune entre la SFEAP et le RFMF autour de l’analyse de données sera organisée à Lyon le 28 mars dans le cadre de Forum Labo (https://framaforms.org/workshop-analyse-et-interpretation-des-donnees-en-proteomique-et-metabolomique-points-communs-et).

SITE du Congrès https://11-js-rfmf-2018.sciencesconf.org/

Le conseil d'administration du RFMF, le RFMF junior ainsi que le comité local d'organisation et le comité scientifique sont heureux de vous annoncer l'organisation des 11èmes journées scientifiques du RFMF à Liège qui se tiendront du 23 au 25 mai 2018.


Les archives des offres et annonces du RFMF sont consultables ici

CDD de 12 mois  
Début prévu au 1er mars 2018
Niveau recherché: Titulaire d’un diplôme de niveau I

Poste Basé à Bordeaux
I

Une formation est organisée par Oliver Kohlbacher, Christoph Steinbeck et Steffen Neumann en Mars 2018

Le RFMF junior s'est doté d'un 10ème membre actif !

SMMAP2017, Marne la Vallée, 02/10/2017
Atelier 2 – Méta-métabolomique

Merci à tous d’avoir participé à ce premier exercice sur un sujet aussi complexe.
Nombre de participants : 35
Suite à nos discussions, voici les points qui nous ont particulièrement marqués.

L'école printanière du RFMF Junior s'est déroulée du mardi 2 au vendredi 5 mai 2017. Cette première édition a tenu toutes ses promesses et a été, grâce à tous ses participants et intervenants, une franche réussite.

Le RFMF junior, soutenu par le RFMF, a eu le plaisir de remettre le premier prix de thèse RFMF.

Vacant position: PostDoc                                                   Venue: University of Geneva, Centre Medical Universitaire
Starting date / duration: November 1st 2017 / 2 years                                Application deadline: September 15, 2017
 

The Research Institute for Chromatography (R.I.C.), a world leading chromatographic and mass spectrometric expert center, is further expanding its activities in the fascinating field of biopharmaceutical analysis. Therefore, the company is looking for a:

Poste ATER, Amiens

18/07/2017

 
Un poste d’ATER (temps plein) est actuellement disponible en section 85, à l’UFR de Pharmacie de l’Université de Picardie Jules Verne à Amiens pour la prochaine année universitaire via la campagne de publication du 21 au 31 aout 2017.
 

A 12 months’ position for a project relating to non-targeted strategies for detection and characterization of emerging and/or not yet known endocrine-disrupting chemicals is available at LABERCA (Oniris, France).
 
The project will be starting in October 2017.
 
Proposal title: “Development of analytical strategies for the detection and characterization of emerging endocrine-disrupting chemicals from complex biological matrices”
Acronym: EMERG-EDC
 

Voici une offre d’ingénieur d’étude en chimie analytique à l’Institut de Chimie de Nice.  Ce recrutement est réalisé dans le cadre du projet Rosascent (financement ANR) qui a pour objectif d’étudier la biosynthèse des terpènes chez la rose (Rosa sp.). Le candidat recruté aura pour principale mission de mettre en œuvre des outils analytiques performants (séparation chirale, GC/FID, GC-MS, UPLC-MS…) pour caractériser les terpènes acycliques et de leurs dérivés naturels (acétates, glycosilés…) chez la rose.

Une offre de thèse en RMN est disponible à l'Université de Nantes, au laboratoire CEISAM (J. Farjon, P. Giraudeau) en collaboration avec le laboratoire GEPEA (O. Gonçalves).
Le projet a pour objectif de développer des méthodes analytiques innovantes pour caractériser les précurseurs chimiques de biocarburants produits par des microalgues. La stratégie proposée repose sur le développement de méthodes en spectroscopie de Résonance Magnétique Nucléaire (RMN) pour l’étude du métabolisme d’accumulation lipidique.

 Mots clés: Metabolomique, MS/MS, Workflow4Metabolomics, Galaxy, R, Intégration d’outil

Contexte
L’émergence du domaine de la métabolomique s’est accompagnée de la génération de vastes ensembles de données caractérisés par différents niveaux de complexité (multidimensionnalité, redondance, bruit,…). Un certain nombre d’outils, procédures, bases de données, et cadres normalisés existent aujourd’hui, mais l’utilisateur doit encore naviguer entre différents logiciels pour les utiliser avec les contraintes d’installation des outils et de reformattage des entréee et sortie des outils. L'environnement Galaxy permet de fédérer ces outils au sein d’une même instance. Dans le cadre du développement de nouveaux outils et du déploiement de nouvelles solutions nous recherchons un(e) ingénieur motivé pour contribuer au projet Workflow4Metabolomics et renforcer les équipes impliquées.
 

CDD 18 mois, Intitulé du poste : Ingénieur d’Etudes en Analyse de Biomolécules Végétales
Date limite de candidature : 15 juillet 2017

A 3-year PhD scholarship for a project on chlorinated paraffins is available at LABERCA (Oniris, France).

Titre: Exploration de la dynamique des modulations du réseau métabolique hépatique lors de l'exposition à un contaminant perfluoré émergent

Mots clés : toxicologie, effets métaboliques, contaminant alimentaire, réseaux métaboliques, bio-informatique, modèles cellulaires, métabolisme hépatique, métabolomique
 
Encadrants & personnes à contacter pour la candidature :
Dr. Daniel Zalko, toxicologue (daniel.zalko@inra.fr)
Dr. Nathalie Poupin, bio-informaticienne (nathalie.poupin@inra.fr)
 

Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique
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