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Contrat post-doctoral – Suivi de la lignocellulolyse par un champignon xylophage

01/06/2015
Contrat post-doctoral – Suivi de la lignocellulolyse par un champignon xylophage, par combinaison d’approches métabolomique et transcriptomique. UMR INRA/AMU Marseille

Les champignons lignolytiques dégradeurs du bois produisent une large panoplie d’enzymes extracellulaires leur conférant la capacité de coloniser une grande diversité de tissus végétaux (bois, plantes, sous-produits agricoles, …). Cette déconstruction des polymères pariétaux met en jeu des systèmes enzymatiques complexes dans lesquels interviennent des hydrolases, estérases, peroxydases et enzymes auxiliaires. En outre, la capacité lignocellulolytique est associée à une forte capacité de métabolisation et de détoxification des molécules dérivées des saccharides et aromatiques libérés. L’unité a identifié une souche à forte aptitude délignifiante, dont le génome est en cours de séquençage en collaboration avec le Joint Genome Institute (DOE, US). Un projet initié avec le Démonstrateur Industriel Toulouse White Biotechnology a pour objectif l’étude des enzymes et voies métaboliques fongiques impliquées dans la lignocellulolyse, par combinaison d’approches métabolomiques et transcriptomiques. L’utilisation d’outils analytiques complémentaires (HPLC, GC-MS, LC-MS) permettra une cartographie large des sucres, acides organiques, et molécules aromatiques libérées au cours de la lignocellulolyse ou générées par le métabolisme fongique. Le chercheur recruté interagira fortement avec les chercheurs de l’Unité Biodiversité et Biotechnologie Fongiques (INRA/AMU), les chercheurs de la Platefome MetaToul et les partenaires industriels de l’unité Toulouse White Biotechnology. Le contrat d’un an sera renouvelé un an sous condition de franchissement d’une étape GO/NO GO après les 12 premiers mois. Le candidat recherché doit avoir des compétences en métabolomique des sucres et des aromatiques, en microbiologie fongique et en transcriptomique. 
 
Date limite de candidature : 08 juin 2015
Date de début du contrat : 1er septembre 2015
Contact : marie-noelle.rosso@univ-amu.fr

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