Journées scientifiques & ateliers passés

9èmes Journées Scientifiques à Lille - 2015

04/01/2016
Les 9èmes Journées Scientifiques du RFMF ont été organisée à Lille du 9 au 11 juin 2015 dans les locaux de Polytech Lille.
https://colloque.inra.fr/9_js_rfmf_lille_2015

9e Journées Scientifiques du RFMF

 

Les Journées Scientifiques du RFMF constituent le rendez-vous annuel majeur de la communauté française et francophone en métabolomique et fluxomique.


9 au 11 juin 2015 - Polytech Lille
en cours de publication...
 
lundi 08 juin 2015
08:30 - 18:00 : Journée satellite : Ateliers et Table Ronde
 8h30 - 12h30 :  Atelier 1 : Imagerie par Spectrométrie de Masse. (1er groupe) - Atelier Complet
                                        Laboratoire PRISM - INSERM U1192 - Bât. SN3 (Rq: sur inscription préalable validée par les animateurs de l'atelier - nombre de places restreint)
14h00 - 18h00 :  Atelier 1 : Imagerie par Spectrométrie de Masse. (2ème groupe)
                                         Laboratoire PRISM - INSERM U1192 - Bât. SN3  (Rq: sur inscription préalable validée par les animateurs de l'atelier - nombre de places restreint)
14h00 - 16h00 :  Table Ronde : Conservation et préparation des échantillons d'origine humaine pour analyses métabolomiques
                                               Salle multimédia A307 - Aile A 3ème étage Polytech (Rq: Nombre de places illimité mais pré-inscription obligatoire)
14h00 - 18h00 :  Atelier 2 : Introduction aux biostatistiques et à l'analyse de données - Atelier Complet
                                         Salle multimédia A319 - Aile A 3ème étage Polytech (Rq: sur inscription préalable validée par les animateurs de l'atelier - nombre de places restreint)
mardi 09 juin 2015
09:00 - 09:30 : Accueil des participants
 
09:30 - 09:35 : Allocution de Bienvenue - Amphi Migeon
Ouverture des 9JS RFMF par Philippe Rollet, Président de l'Université de Lille1. 
09:40 - 09:45 : Allocution de Bienvenue
Bruno Desprez, Président du pôle de compétitivité Nutrition Santé Longévité.
09:50 - 10:00 : Introduction aux 9e Journées Scientifiques
Jean-Louis Hilbert du Comité d'Organisation des 9 JS RFMF et Dominique Rolin du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique.
09:55 - 10:00 : Annonce Challenge CASMI 2016
9:55 - 10:00 : Annonce Challenge CASMI 2016 (Critical Assessment of Small Molecule Identification)
                      Grégory Genta-Jouve, Paris, France
10:00 - 10:40 : Conférence invitée (1) - Amphi Migeon
Chairman: François Coutte, Polytech Lille, France                       
                        10h00 - 10h40 :   Insights into the physiology of bacteria through metabolome analysis. Michael Lalk, Greifswald, Allemagne.
10:45 - 10:55 : Session Flash (1)
Chairman: François Coutte, Polytech Lille, France
               10h45  PeakForest: a spectral reference database made from metabolomic experts for metabolomic analyses. Nills Paulhe. Saint-Genès Champanelle, France.
               10h55 Nouveautés et solutions de screening ciblés des métabolites primaires et des médiateurs  lipidiques.Thierry Legoupil, Shimadzu France
10:55 - 11:50 : Applications de la métabolomique en biotechnologie
Chairman : Jean-Charles Martin, Marseille, France 
                      10h55 - 11h10 :  Bacteria exo-metabolome analysis and species discrimination from untargeted NMR profiling. Tony L. Palama, Lyon, France.
                      11h15 - 11h30 :  LC-HRMS-based metabolomics differenciates clinically relevant methicillin resistant and methicillin susceptible Staphylococcus aureus strains based on their basal physiology. Sandrine Aros-Calt, Saclay, France.
                      11h35 - 11h45 :  Discrimination par métabolomique (LC-MS) de souches bactériennes issues de biofilms marins.  Laurie Favre, La Garde (83), France. RFMF Junior
11:50 - 12:05 : Session Flash (2)
Chairman : Jean-Charles Martin, Marseille, France
                        11h50 Nouvelles solutions Waters pour les sciences omiques. Freddy Drouyé, Waters, France , Waters.
                        11h55  Phenotypic, Transcriptomic and Metabolomic analysis of the interactions between seed coat and embryo of flaxseed. Fabien Miart, Amiens, France.
                        12h00  From Metabolic Phenotyping Data to Disease-Specific Signatures. Guido Krebiehl, Biocrates, Innsbruck, Autriche.
12:00 - 14:00 : Buffet et Séminaires Industriels

Amphi Migeon
12h45 - 13h15: Nouveautés en spectrométrie de masse à mobilité ionique et en imagerie DESI pour le screening et la métabolomique.
Emmanuelle Claude, Waters Manchester et Freddy Drouyé, Waters France
13h20 - 13h50: From Metabolic Phenotyping Data to Disease-Specific Signatures.
Guido Krebiehl, Biocrates , Autriche
Amphi Appert
12h45 - 13h50: Early-Member Network - Metabolomics Society
Agneta Kiss et Justin van der Hooft
 
 
14:00 - 14:40 : Conférence invitée (2) - Amphi
Chairman: Christophe Junot, Saclay, France                       
                        14h00 - 14h40 :   Integrated (ultra)high resolution analytical approaches for non-targeted metabolomics analyses; application to meta-metabolomics of microbiomes. Philippe Schmitt-Kopplin, Neuherberg, Allemagne.
14:45 - 15:00 : Session Flash (3)
Chairman: Christophe Junot, Saclay, France
                        14h45 Using Ion chromatography with high resolution accurate mass spectrometry (IC-HRAM) for metabolomics. Claire Dauly, Thermo Fisher Scientific.
                        14h50  Metabolomic tools dedicated to drug discovery in the field of inherited metabolic diseases. Application to Creatine Transport Deficiency. Camille Moreau, Lille, France.
                       
                        14h55 Update sur les solutions Sciex en Métabolomique et Lipidomique. Ernst Bouvin, SCIEX, Belgique.
15:05 - 16:35 : Sessions parallèles Application de la Métabolomique/Fluxomique en microbiologie et en Santé
  • Session parallèle A – Amphi Appert
Session Application de la Métabolomique/Fluxomique en Microbiologie 
Chairman : Floriant Bellvert, Toulouse, France
                      15h05 - 15h20 :  Profilage métabolique et contrôle d’hypothèses à travers des cinétiques d’accumulation ou d’élimination des métabolites secondaires associés à la phycotoxicité de bivalves filtreurs. Florence Mondeguer, Nantes, France.
                      15h25 - 15h40 :  Characterization of the central carbon metabolism of Arthrospira platensis cultivated in contrasted conditions in photobioreactor.  Myriam Phélippé, Saint-Nazaire, France.
                      15h45 - 16h00 :  Comprehensive investigation of metabolic flexibility in the parasite Trypanosoma brucei.  Edern Cahoreau, Toulouse, France.
                      16h05 - 16h20 :    A Modeling Language for Reaction Networks with Partial Kinetic Information: Flux Analysis and Knockout Prediction.  Joachim Niehren, Lille, France.
                      16h25 FlashReconstruction du réseau métabolique de la tomate.  Florence Maurier, Toulouse, France.
                     16h30 Flash :  Impact of mineral supply (Cu and Zn) on the metabolism of alfalfa stem. Jenny Renaut, Belvaux, Luxembourg.
  • Session parallèle B – Amphi Migeon
Session Application de la Métabolomique en Santé
Chairman : Terence Beghyn, Lille, France
                      15h05 - 15h20 :  Biomarkers in ALS (amyotrophic lateral sclerosis): combining metabolomics and clinical parameters to define phenotype and disease progression. Hélène Blasco, Tours, France.
                      15h25 - 15h40 :  Intérêt de l’analyse métabolomique du globule rouge pour la stratification des patients diabétiques.  Lydie Oliveira, Paris, France.
                      15h45 - 16h00 :   New translational metabolomic exploration of age-related macular degeneration: from patients to functional implication of lactate.  Sylvain Hansen, Sart-Tilman, Belgique.
                      16h05 - 16h15 :   Exploration de la composante métabolique du Syndrome de West par une approche métabolomique non ciblée et ciblée du LCR par LC-HRMS. Blandine Madji Hounoum, Tours, France. RFMF Junior
                      16h20 - 16h30 :   Study of ischemia-reperfusion injury in mouse kidney and urine by metabolomics. Justine Leenders Liège, Belgique. RFMF Junior
16:35 - 16:55 : Pause - Echanges informels - Visite Stands (1)
 
16:55 - 17:50 : Session Posters
17:50 - 19:20 : Assemblée générale du RFMF - Amphi Migeon
 
mercredi 10 juin 2015
09:00 - 09:40 : Conférence invitée (3) - Amphi Migeon
Chairman: Jean-Louis Hilbert, Lille, France                       
                        9h00 - 9h40 : Metabolomics: a key technology for plant sciences. Robert Verpoorte, Leiden, Pays-Bas.
09:45 - 10:05 : Session Flash (5)
Chairman: Jean-Louis Hilbert, Lille, France
                        9h45  Aggressive automated LC-MS/MS data annotation: A CASMI experience.  Yann Guitton, Nantes-Rennes, France.
                        9h50  Les News Agilent ASMS 2015. Luc Arnaud, Agilent Technologies.
                        9h55  Développement d'une approche métabolomique pour la caractérisation de l’exposition des organismes aquatiques à des résidus de médicaments. Frédérique Courant, Montpellier, France.
                       10h00  Nouveautés Bruker. Olivier Assemat, Wissembourg (67), France.
10:05 - 10:35 : Sessions parallèles Agrosressources et Environnement / Développement Peptidomique
  • Session parallèle A – Amphi 
Session Agrosressources et Environnement
Chairwoman: Annick Moing, Villenave d’Ornon, France
                        10h05 - 10h20Génomique fonctionnelle du métabolisme de défense de la vigne.  David Halter, Colmar, France.
                        10h25 - 10h35 :  Etude des changements métaboliques associés à la mutation des Pinorésinol Réductases d’Arabidopsis thaliana par analyses LC/MS, GC/MS et RMN.  Cédric Decourtil, Amiens, France. RFMF Junior
  • Session parallèle B – Amphi 
Session Développement Peptidomique
Chairman: Christophe Junot, Saclay, France
                     10h05 - 10h20 : Could plant cells produce Non Ribosomal Peptides, a family of bioactive microbial secondary metabolites with a remarkable biodiversity? Philippe Jacques, Villeneuve d’Ascq, France.
                     10h25 - 10h35 :  Etude des marqueurs protéiques et de leurs flux physiologiques par LC-MS/MS : cas de l’apolipoprotéine (a). Mikaël Croyal, Nantes, France. RFMF Junior
10:40 - 11:10 : Pause - Echanges informels - Visite Stands (2)
 
11:10 - 12:05 : Sessions parallèles Agroressources et Environnement / Alimentation
  • Session parallèle A – Amphi 
Session Agroressources et Environnement (suite)
Chair.wo.man: XX, Ville, Pays
                        11h10 - 11h25 : Unravelling the architecture and dynamics of tropane alkaloid biosynthesis pathways using metabolite correlation networks.  Rebecca Dauwe, Amiens, France.
                        11h30 - 11h45 :  Cellular and subcellular metabolomics reveal changes during tomato leaf development. Martine Dieuaide-Noubhani, Villenave d'Ornon (33), France.
                        11h50 - 12h00 :  Metabolic dissection of leaf senescence and nutrient remobilization in oilseed rape. Sylvain Déchaumet, Le Rheu (35), France. RFMF Junior
  • Session parallèle B – Amphi 
Session Alimentation
Chair.wo.man: XX, Ville, Pays
                     11h10 - 11h25 : Milk glycomics : Development of an LC-MS-based approach to analyze free oligosaccharides in human milk.   François Fenaille, Gif-sur-Yvette, France.
                        11h30 - 11h45 :  Microbiological alteration of egg products during their production process: discovery of early prediction biomarkers. Rémi Coat, Saint-Nazaire (44), France.
                        11h50 - 12h00 :  Characterization and traceability of matrices rich in triacylglycerols using an Isotopomic approach. Noëlle Merchak, Nantes, France et Beyrouth, Liban. RFMF Junior
12:05 - 14:00 : Buffet et Séminaires Industriels
 
  Amphi Migeon
Chairman: Philippe Hance, Lille, France
Amphi Appert
Chairman: Mostafa Kouach, Lille, France
 12h45 - 13h15:  Agilent Technologies - ANNULE Nouveautés et solutions de screening ciblés des métabolites primaires et des médiateurs  lipidiques.
Thierry Legoupil, Shimadzu France
     
13h20 - 13h50: Update on Targeted screening, metabolomic discovery and structure verification software solutions.
Sabine Jourdain et Alexandre Verdu, Bruker Daltonics
Martial Piotto et Olivier Assemat, Bruker BioSpin
Recent Developments in Metabolomics Research by CESI-MS.
Claire Levasseur, SCIEX France et Jim Thorn, SCIEX Separations EMEA, Royaume-Uni.
14:00 - 14:25 : Session Agroressources et environnement (suite)
Chairman: Philippe Jacques, Villeneuve d’Ascq (59), France
                        14h00 - 14h10 : Mass spectrometry based metabolomic analysis of flax seed exudates: temporal release of secondary metabolites.  Benjamin Thiombiano, Amiens, France. RFMF Junior
                        14h15 - 14h25 :  Impact of environnemental conditions on the flaxseed (Linum usitatissimum) metabolic profile. Romain Roulard, Amiens, France. RFMF Junior
14:30 - 14:45 : Session Flash (6)
Chairman: Philippe Jacques, Villeneuve d’Ascq (59), France
                       
                        14h30  The Metabolomic Informative Content (MIC): a clustering-based approach to measure the amount of captured signal in spectra. Baptiste Feraud, Louvain-la-Neuve, Belgique.
                        14h35  State-of-the-art LC-MS based lipidomics applied to the study of lung diseases. Ruben t'Kind, Kortrijk, Belgique.
                        14h40  TBA. Yann Simon, LECO France.
14:40 - 15:30 : Développements méthodologiques en métabolomique, fluxomique, lipidomique...
Chairwoman: Frédérique Courant, Montpellier, France
                        14h40 - 14h55 :   In situ identification and imaging of metabolites using high resolution mass spectrometry. Gregory Hamm, Loos (59), France.
                        15h00 - 15h15 :  Development of a high resolution based lipidomic workflow to investigate the human cerebrospinal fluid.  Alexandre Seyer, Gif-sur-Yvette, France.
                        15h20 - 15h30 :  Application of a LC-HRMS method for identification, quantification and isotopomer profiling of Acyl-CoA thioesters. Maria Fatarova, Toulouse, France. RFMF Junior
15:40 - 15:55 : Session Flash (7)
Chairwoman: Frédérique Courant, Montpellier, France
                        15h40  Détermination de marqueurs précoces de stéatose par imagerie moléculaire du foie. Laëtitia Théron, Saint-Genès Champanelle, France.
                        15h45  A R package for an optimal 1H-NMR spectral data pretreatment strategy. Manon Martin, Louvain, Belgique.
                        
                        15h50  Cells with defective enzymatic activity of succinate dehydrogenase continue to respire. Doriane Lorendeau, Leuven, Belgique.
16:00 - 16:30 : Session pédagogique Masters Lyon
Chairman: Dominique Rolin, Villenave d’Ornon (33), France
                16h00 : Présentation du Master Pro Phytoressources Université Claude Bernard Lyon1. Carole Lapalus, La Garde (83), France.
                16h05 : Optimisation de l’étape de filtration pour le criblage large spectre de plus de 700 micro-polluants dans l’eau par une approche métabolomique. Antoine Buonomo, Boulogne-Billancourt, France.  
                16h15 : Diversité des empreintes métabolomiques en lien avec le potentiel toxinogène chez le champignon phytopathogène Fusarium graminearum. Antoine Escourrou, Villenave d’Ornon (33), France.
16:30 - 17:00 : Pause - Echanges informels - Visite Stands
 
17:00 - 17:55 : Session Posters
17:50 - 18:50 : Assemblée générale du RFMF Junior
 
19:45 - 23:00 : Repas des 9JS RFMF
 
jeudi 11 juin 2015
09:00 - 09:55 : Sessions parallèles Développement analytique / Applications de la métabolomique en nutrition-santé
  • Session parallèle A – Amphi Migeon
Session Développement analytique
Chairman: Pascal de Tullio, Liège, Belgique
                        9h00 - 9h15 :   Apport de la technologie Orbitrap Fusion pour l’exploitation du massif isotopique en métabolomique.  Pierre Barbier Saint Hilaire, Gif-sur-Yvette, France.
                        9h20 - 9h35 :  A Workflow for the Assessment of the quality of Isotopologue Distribution Measurements by Mass Spectrometry.  Maud Heuillet, Toulouse, France.
                        9h40 - 9h55 :  RMN 2D rapide pour la métabolomique quantitative ciblée d'extraits végétaux. Patrick Giraudeau, Nantes, France.
  • Session parallèle B – Amphi Appert
Session Applications de la métabolomique en nutrition-santé
Chairman: Jean-François Goossens, Lille, France
                        9h00 - 9h15 :   Targeted GC-MS/MS metabolomics to suspect immune castration by Improvac® administrations in the male horse.  Benoît Loup, Verrières-le-Buisson (91), France.
                        9h20 - 9h35 :  Integrated and predictive approach for identifying markers of health status evolution toward metabolic syndrome: the role of nutrition. Estelle Pujos-Guillot, Saint-Genès Champanelle (63), France.
                        9h40 - 9h55 :  Un biomarqueur métabolomique multiplexe permet de prédire le vasospasme chez des patients souffrant d’un accident vasculaire cérébral hémorragique. Jean-Charles Martin, Marseille, France.
                       
10:05 - 10:45 : Conférence invitée (4) - Amphi Migeon
Chairman: Fabien Jourdan, Toulouse, France                       
                        10h05 - 10h45 :   From Metabonomics to Pharmacometabonomics: Mice, Men and Microbiota. Jeremy Everett, Greenwich, Royaume-Uni.
10:50 - 11:15 : Pause - Echanges informels - Visite Stands
 
11:15 - 12:10 : Session Développements méthodologiques en bioinformatique et traitements statistiques - Amphi Migeon
Chairman: Fabien Jourdan, Toulouse, France
                       11h15 - 11h25 :    Unlocking the power of untargeted metabolomics experiments: Enhanced Metabolite Annotation by Mass Fragmentation Analysis.  Justin J.J. van der Hooft, Glasgow, Ecosse. RFMF Junior
                       11h30 - 11h45 :  Analysis of metabolomic data from designed experiments using ANOVA Multiblock Orthogonal Partial Least Squares. Julien Boccard, Genève, Suisse.
                       11h50 - 12h05 :  How to detect metabolite stress induction in mixed metabolomes? Fungal co-culture as a school case. Samuel Bertrand, Genève-Lausanne, Suisse et Nantes, France.
                       12h10 - 12h25 :  Décomposition de la variance d'origine métabolique selon le cultivar, la dose de maïs génétiquement modifié incorporé dans l'aliment et le génétiquement modifié incorporé dans l'aliment et le genre du modèle-animal utilisé pour évaluer les aliments GM. Alain Paris, Paris, France.
12:30 - 12:40 : Clôture de 9 JS RFMF

Liste de diffusion du RFMF ouverte à tous et gratuite.

Depuis le 1er Janvier 2017 la liste de diffusion est ouverte à tous, Pour vous inscrire suivez le lien.

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