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CDD 12 mois Ingénieur Platefomre Marseille

08/03/2018
Le profil du poste recherché
Recrutement d'un ingénieur métabolomique en spectrométrie de masse haute résolution
Poste en CDD de d’un an, à pourvoir dès que possible.
Localisation: Unité NORT INRA1260/INSERM1062/AMU, faculté de Médecine la Timone,
27 boulevard Jean Moulin, 13385 Marseille
contact: JC Martin, tél 04 91 32 46 63/07 77 23 00 34, jean-charles.martin@univ-amu.fr


Compétences requises
  • Vous êtes docteur en sciences de la vie ou en chimie des petites molécules.
  • Vous avez une expérience déjà confirmée en spectrométrie de masse (GCMS, LCMS haute résolution, MS- MS/MS, type QTOF préférentiellement) appliquée à la métabolomique ciblée/non-ciblée et si possible à la lipidomique non ciblée, et à la quantification.
  • vous êtes capables d'assurer la maintenance courante d'un spectromètre de masse et
êtes autonome sur son utilisation.
  • vous utilisez les logiciels d'extraction des données spectrales (MZmine, XCMS, ...), et
du traitement post-acquisition (workflow4metabolomics, scripts sous R), maitrisez les
outils d'interrogation des banques de données.
  • Vous avez une expérience dans l'extraction des métabolites issus de matrices
biologiques complexes (tissus et biofluides animaux).
  • Vous êtes autonome pour l’utilisation des outils statistiques de base en métabolomique
(statistiques multivariées de type ACP, PLS, utilisation de Metaboanalyst, cytoscape,
  •  
Missions
  • Vous aurez la responsabilité de la gestion des projets de recherches partenariaux,
  • vous réaliserez les analyses métabolomiques par LC-MS (préparation des échantillons,
  • analyses par LC/MS, et traitement de données jusqu'aux analyses statistiques
avancées), et l’annotation des molécules par consultation des banques de données.
  • Quand cela sera nécessaire, Vous effectuerez les interprétations biologiques à l’aide d’un workflow dédié utilisant notamment la visualisation sous forme de réseaux (formation fournie sur place).
  • vous serez à même de développer de nouveaux protocoles spécifiquement adaptés à
chaque problématique, en lien avec les chercheurs et responsables analytiques de la
  •  
  • vous rédigerez les rapports d’activité et participerez à la rédaction des publications.
  • vous serez capable de présenter vos résultats en conférence.
  • vous serez capable d'encadrer et de former.
Qualités
Bon relationnel et sens aigu du travail en équipe, bon esprit organisationnel et des contraintes liées au respect d'un agenda.
Curieux(se), envie d’être impliqué(e) dans la vie de l’équipe, goût prononcé pour la nouveauté.
Justificatifs à fournir
CV et lettre de motivation
Liste des publications et des réalisations avérées
Deux lettres de soutien
Environnement de travail
La mission sera réalisée sur le site de la plateforme BioMeT/CRIBIOM
(http://www.rfmf.fr/site-de-competences/ et http://www.protisvalor.com/site/fr/cribiom),
adossée à l’unité NORT (UMR INRA/INSERM/AMU), localisée sur le site de la faculté de
médecine La Timone à Marseille. La plateforme est équipée de 2 spectromètres de masse à
haute résolution (QTOF et orbitrap Qexactive+), et d’un GCMS basse résolution.
Nous considérons que la réussite de la mission comprend non seulement l’atteinte des
objectifs, mais également l’épanouissement personnel du candidat recrutée.
 

Prochaines Journées scientifiques 2019

Prochaines journées scientifiques: en 2019, le RFMF organise ses 12èmes journées scientifiques à Clermont-Ferrand

Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique
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