SMMAP2017, Marne la Vallée, 02/10/2017
Atelier 2 – Méta-métabolomique
Merci à tous d’avoir participé à ce premier exercice sur un sujet aussi complexe.
Nombre de participants : 35
Suite à nos discussions, voici les points qui nous ont particulièrement marqués.

L'école printanière du RFMF Junior s'est déroulée du mardi 2 au vendredi 5 mai 2017. Cette première édition a tenu toutes ses promesses et a été, grâce à tous ses participants et intervenants, une franche réussite.

Le RFMF junior, soutenu par le RFMF, a eu le plaisir de remettre le premier prix de thèse RFMF.

Post-Doctorat 2 ans INRA Toulouse

Vacant position: PostDoc                                                   Venue: University of Geneva, Centre Medical Universitaire
Starting date / duration: November 1^st 2017 / 2 years                                Application deadline: September 15, 2017
 

The Research Institute for Chromatography (R.I.C.), a world leading chromatographic and mass spectrometric expert center, is further expanding its activities in the fascinating field of biopharmaceutical analysis. Therefore, the company is looking for a:

A 12 months’ position for a project relating to non-targeted strategies for detection and characterization of emerging and/or not yet known endocrine-disrupting chemicals is available at LABERCA (Oniris, France).
 
The project will be starting in October 2017.
 
Proposal title: “Development of analytical strategies for the detection and characterization of emerging endocrine-disrupting chemicals from complex biological matrices”
Acronym: EMERG-EDC
 

Voici une offre d’ingénieur d’étude en chimie analytique à l’Institut de Chimie de Nice.  Ce recrutement est réalisé dans le cadre du projet Rosascent (financement ANR) qui a pour objectif d’étudier la biosynthèse des terpènes chez la rose (Rosa sp.). Le candidat recruté aura pour principale mission de mettre en œuvre des outils analytiques performants (séparation chirale, GC/FID, GC-MS, UPLC-MS…) pour caractériser les terpènes acycliques et de leurs dérivés naturels (acétates, glycosilés…) chez la rose.

Une offre de thèse en RMN est disponible à l'Université de Nantes, au laboratoire CEISAM (J. Farjon, P. Giraudeau) en collaboration avec le laboratoire GEPEA (O. Gonçalves).
Le projet a pour objectif de développer des méthodes analytiques innovantes pour caractériser les précurseurs chimiques de biocarburants produits par des microalgues. La stratégie proposée repose sur le développement de méthodes en spectroscopie de Résonance Magnétique Nucléaire (RMN) pour l’étude du métabolisme d’accumulation lipidique.

 Mots clés: Metabolomique, MS/MS, Workflow4Metabolomics, Galaxy, R, Intégration d’outil

Contexte
L’émergence du domaine de la métabolomique s’est accompagnée de la génération de vastes ensembles de données caractérisés par différents niveaux de complexité (multidimensionnalité, redondance, bruit,…). Un certain nombre d’outils, procédures, bases de données, et cadres normalisés existent aujourd’hui, mais l’utilisateur doit encore naviguer entre différents logiciels pour les utiliser avec les contraintes d’installation des outils et de reformattage des entréee et sortie des outils. L'environnement Galaxy permet de fédérer ces outils au sein d’une même instance. Dans le cadre du développement de nouveaux outils et du déploiement de nouvelles solutions nous recherchons un(e) ingénieur motivé pour contribuer au projet Workflow4Metabolomics et renforcer les équipes impliquées.
 

CDD 18 mois, Intitulé du poste : Ingénieur d’Etudes en Analyse de Biomolécules Végétales
Date limite de candidature : 15 juillet 2017

A 3-year PhD scholarship for a project on chlorinated paraffins is available at LABERCA (Oniris, France).

Titre: Exploration de la dynamique des modulations du réseau métabolique hépatique lors de l'exposition à un contaminant perfluoré émergent

Mots clés : toxicologie, effets métaboliques, contaminant alimentaire, réseaux métaboliques, bio-informatique, modèles cellulaires, métabolisme hépatique, métabolomique
 
Encadrants & personnes à contacter pour la candidature :
Dr. Daniel Zalko, toxicologue (daniel.zalko@inra.fr)
Dr. Nathalie Poupin, bio-informaticienne (nathalie.poupin@inra.fr)
 

Title
Innovative data mining strategies for natural extracts metabolomics, natural products dereplication and bioactives identification.

OBJET DU POSTE
L'un des principaux objectifs du Groupe Biomarqueurs (BMA) est le recueil de données métabolomiques complexes par spectrométrie de masse dans le cadre d'études épidémiologiques et d’intervention sur l'étiologie du cancer.

Une école chercheur métabolomique « Comprendre et initier des analyses en métabolomique » cofinancé par corebiopaca et le rfmf a été organisée à Marseille (Station d’Endoume) le 12 et 13 déc 2016.

Niveau recherché/mission générale : Ingénieur(e) de Recherche, chargé(e) d’animer un réseau de plates-formes et des projets analytiques en « analyse structurale et métabolomique »
 
Mots clés : Animation, Gestion Projet, Métabolomique
 

Sujet : Développement d’approches de profilage non ciblé pour la mise en évidence de dangers chimiques émergents : application à l’identification de nouveaux marqueurs d’exposition interne chez l’Homme au service de la biosurveillance et de l’étude du lien entre exposition chimique et santé humaine

 

Title: Overcoming the challenge of biomarkers structural elucidation

For further information please contact the project coordinator, Dr Gaud Dervilly-Pinel (gaud.dervilly@oniris-nantes.fr)
Application Please submit your application no later than 17th March 2017.

Le RFMF Junior lance sa première école printanière !

Rendez-vous du mardi 2 au vendredi 5 mai 2017.

Le RFMF Junior lance sa première école printanière !

Rendez-vous du mardi 2 au vendredi 5 mai 2017.

Cette année encore, les JS ont été un moment riche: rencontres, science, partage. Grâce au comité local d'organisation, au CA du RFMF, au comité scientifique et aux animateurs des ateliers, mais surtout grâce à tous les participants, ces journées ont tenu toutes leurs promesses.

   Elles ont aussi été l'occasion pour les juniors de se réunir autour de deux évènements importants: la première table ronde et l'élection du nouveau CA.

   Nous tenons bien évidemment à remercier tous les jeunes présents lors de la table ronde et qui, par leur motivation et leur participation, ont contribué à son bon déroulement et la richesse des échanges. Beaucoup d'idées et d'avis ont été donnés à propos de recherche d'emplois et de réseaux. Nous préparons pour tous un retour sur l'essentiel échangé lors de cette rencontre.

   Pour la première fois depuis sa création, le RFMF Junior a aussi organisé l'élection de son nouveau CA. Une fois de plus, nous vous remercions pour votre participation à ce moment important dans la vie de notre réseau. 9 membres du CA ont ainsi été élus à la fin de notre assemblée générale:

Sandrine Aros-Calt
Djawed Bennouna
Antoine Buonomo
Sylvain Dechaumet
Grégory Genta-Jouve
Maximilien Gonçalves-Martins
Corentine Goossens
Justine Leenders
Guillaume Meiffren

Attention candidatures avant le 30/11/2016!

Attention délais de réponse court (21/11/2016)

Thèse Cifre Amélioration de la production d’arômes atypiques par les levures oenologiques au cours du procédé de fermentation. Montpellier

URGENT CDD 12 mois – Assistant ingénieur en techniques d’analyse de biomolécules (emploi type CNRS B3A21)
 

Félicitations à Christophe Junot pour son élection à la Metabolomics Society:

Election of Directors
We are pleased to announce that the following have been elected to the Board of Directors of the Metabolomics Society for 2016:

Dr Christophe Junot, CEA, Paris, France (newly elected)

Proposition de stage Master 2 (6 mois), année universitaire 2016-2017 :
Développement d’une méthode de quantification des polyphénols du chocolat par UHPLC-MRM-MS